10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0060 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0060  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000313438  normal  0.60416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0038  tRNA-OTHER  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0047  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0060  tRNA-Pro  92 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00280005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0042  tRNA-OTHER  89.33 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00993442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0010  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0033  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0302721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>