9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0042 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>