10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0018 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0001  tRNA-Val  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.330961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0042  tRNA-Val  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>