11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0001 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0001  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.330961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  HUTA_t5  tRNA-Trp  100 
 
 
177 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0031  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>