197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0534 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0031  tRNA-Pro  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0026  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0041  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0027  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0028  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0102349  hitchhiker  0.000264147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4569  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0425443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0007  tRNA-Pro  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647879  normal  0.980358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0007  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0059  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0004  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000393504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0096  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.859581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0096  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00062  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0002  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3847  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.779981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3834  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0179595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0002  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3956  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0473584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  89.58 
 
 		 1485 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4016  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3912  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4915  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4705  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5079  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3866  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0011  tRNA-Pro  88.33 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.908816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0010  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0036  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00692633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>