299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0098 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0122  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00712397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0144  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0028  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00514358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0142  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0027  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00246876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0103  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727228  decreased coverage  0.000000214334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0017  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0016  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0142  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0038  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000899293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0143  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0046  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000453767  hitchhiker  0.0000828502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0130  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0048  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000100606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0141  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.122826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0123  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0167093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0027  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t107  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t098  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000663033  normal  0.0932756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t001  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t024  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t097  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t098  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0017  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000587442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0117  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.196066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0026  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000193021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0016  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0131  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0022  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0023  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000214609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0117  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000471019  normal  0.0136219 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0117  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000010533  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0134  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000115424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0135  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000102707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0089  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0022  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0023  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0114  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000342233  normal  0.573602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0116  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.145812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0021  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000217303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0022  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00039101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0087  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0020  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0021  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0022  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.281801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0087  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686705  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4322  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000374213  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00070  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000213346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4145  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000725201  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0104  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000101126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4713  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43285e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0096  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4160  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4164  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4263  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000112218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4129  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17442  normal  0.148505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0088  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4214  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000749562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4160  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0004  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0094  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000259411  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0528  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000899305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0002  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0086  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0045  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0152131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0002  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.236408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0121  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000547539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4202  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22322e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0006  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000337222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5090  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5235  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000789982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0011  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000391408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4295  tRNA-Pro  90 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0002  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0099  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4158  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  97.78 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0046  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000279997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0123  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000571932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0124  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000273434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>