133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0031 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647879  normal  0.980358 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0031  tRNA-Pro  97.73 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0059  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0036  tRNA-Pro  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1470  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1685  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.443459  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1763  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2042  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000171349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0033  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273821  hitchhiker  0.000950715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  91.67 
 
 		 1485 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna31  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00062  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0002  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0004  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000393504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0096  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.859581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0012  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0096  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4705  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5079  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4915  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0002  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3866  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4016  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3912  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3956  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0473584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3834  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0179595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3847  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.779981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0104  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000101126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1222  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.335805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0002  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0094  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000259411  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4202  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22322e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4713  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43285e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5090  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0528  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000899305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4129  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17442  normal  0.148505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0002  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.236408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0045  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0152131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0121  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000547539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4164  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4158  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0067  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4214  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000749562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>