12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0053 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.297714  normal  0.2473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0009  tRNA-Val  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0038  tRNA-Val  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0029  tRNA-Val  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0008  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>