15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0038 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0009  tRNA-Val  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0053  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.297714  normal  0.2473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0029  tRNA-Val  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0003  tRNA-Val  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197123  normal  0.950412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>