41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0026 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0014  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0005  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0804752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0009  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.31533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0042  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123264  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  92.59 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2174  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.333692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0557  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0474  methanol dehydrogenase beta subunit  100 
 
 		 306 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0038  tRNA-Val  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>