19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0042 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414073  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.43 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>