16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0031 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.213093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0030  tRNA-Val  97.33 
 
 		 74 bp  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.767632  normal  0.452348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0039  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0005  tRNA-Val  93.33 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0035  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.291338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0051  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0184083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0032  tRNA-Val  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0044  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0008  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.30221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0050  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.657878  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0029  tRNA-Val  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00283312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>