11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0023 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0018  tRNA-Glu  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0290515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0019  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0070  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0294243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0049  tRNA-OTHER  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>