79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0036 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0038  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835674  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0040  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0027  tRNA-Val  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.20425  decreased coverage  0.00178196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14170  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25090  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.657176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1179  tRNA-Asp  86.44 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.015483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12080  tRNA-Val  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.143948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0012  tRNA-Val  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121367  normal  0.0933113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0046  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0005  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0028  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.897252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0022  tRNA-Val  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.267849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0007  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0041  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0017  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0599655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0038  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00492352  normal  0.805671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>