More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0017 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.897252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0599655  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0038  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00492352  normal  0.805671 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0035  tRNA-Ile  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0034  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0065  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00143134  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0014  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.207182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0028  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0035  tRNA-Ile  93.1 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.849815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0047  tRNA-Ile  93.1 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0014  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0042  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0048  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0032  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0014    87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA17  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0055  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0069  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA9  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  87.5 
 
 
79 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  87.5 
 
 
79 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>