12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12080  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.143948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0038  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835674  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0040  tRNA-Val  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0036  tRNA-Val  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0047  tRNA-Val  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0045  tRNA-Val  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000126264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0010  tRNA-Val  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.564067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.394073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>