9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0006 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  96.97 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0026  tRNA-Glu  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0391108  normal  0.06286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>