12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0038 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0013  tRNA-Gln  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0422006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0014  tRNA-Gln  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0056  tRNA-Gln  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0607311  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0035  tRNA-Gln  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t70  tRNA-Gln  91.67 
 
 
121 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0010  tRNA-Gln  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.78413 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000136708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>