23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0031 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  94.85 
 
 		 97 bp  153  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 97 bp  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 98 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 104 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 122 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  90 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 130 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 101 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>