20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0002 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0080  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0207378  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17550  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.15703  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0056  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.877587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0046  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00480232  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0038  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>