64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0012 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  88.61 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  97.56 
 
 		 97 bp  73.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 104 bp  73.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 98 bp  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 96 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 92 bp  58  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  85.53 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  54  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  94.12 
 
 		 99 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 98 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t20  tRNA-Arg  100 
 
 		 124 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 101 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 122 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  88.89 
 
 		 101 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 99 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0007  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.31683  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 119 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0026  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 111 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  86.96 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>