65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0027 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  96.2 
 
 		 79 bp  133  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 78 bp  89.7  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  88.61 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  86.08 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  92.86 
 
 		 97 bp  60  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 99 bp  54  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 97 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  84.42 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 118 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  85.07 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  88.64 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    96.43 
 
 		 366 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  90 
 
 		 97 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t20  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 124 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 122 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 97 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 101 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  83.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 97 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>