18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0006 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 94 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    96.43 
 
 		 366 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  88.37 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>