22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0024 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  83.82 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 130 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>