43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0022 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0007  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 139 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.249793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0004  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0006  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.202736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA47  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.327653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0374  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2383  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2524  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1714  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199477  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1521  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 70 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.637117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0622  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0832  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>