299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0040 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0045  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 139 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.249793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t27  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t29  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.201706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t44  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t45  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t46  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00513183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02887  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_003295  RS04530  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000141295  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04532  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000147754  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t46  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t47  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t49  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA27  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237638  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000082024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA30  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000254834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0063  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748951  normal  0.206184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0017  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0025  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000547625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000186167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2471  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2621  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000284605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2623  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000119328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R26  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223241  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R28  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771602  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R37  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000184808  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0064  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000566491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0024  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.16238  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0025  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103227  normal  0.238575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0018  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291088  normal  0.300021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193978  normal  0.0518399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0123  tRNA-Asp  100 
 
 		 91 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.015357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0030  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000504867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21810  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000145079  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24120  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000157836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24130  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000273209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41200  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259841  normal  0.399457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>