22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0020 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  90.11 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>