9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0004 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0022  tRNA-Arg  98.44 
 
 		 73 bp  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0054  tRNA-Arg  95.08 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.386889  normal  0.10175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0022  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0047  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.363261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>