19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0022 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.363261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0022  tRNA-Arg  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0054  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.386889  normal  0.10175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0004  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0269347  normal  0.199214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>