21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0020 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0004  tRNA-Arg  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0025  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.876987  hitchhiker  0.00000168778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0054  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.386889  normal  0.10175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0022  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 70 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.637117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>