13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MTHE_0 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0004  tRNA-Arg  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>