89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0042 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0015  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0025  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000303691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0039  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0005  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309086  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309117  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309161  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0009  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.175889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0038  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.63633e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000206186  hitchhiker  0.00000000390519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0044  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0036  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0602741  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000220683  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000021714  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>