37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0033 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0015  tRNA-Arg  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0025  tRNA-Arg  88.06 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000303691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0039  tRNA-Arg  88.06 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0005  tRNA-Arg  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309161  tRNA-Arg  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309117  tRNA-Arg  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309086  tRNA-Arg  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0009  tRNA-Arg  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.175889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  86.57 
 
 
73 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000206186  hitchhiker  0.00000000390519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0038  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.63633e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>