50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0009 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.175889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0039  tRNA-Arg  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0025  tRNA-Arg  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000303691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0015  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  87.14 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000753452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  88.33 
 
 
73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0011  tRNA-Arg  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09370  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0004  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000109106  hitchhiker  0.000000979615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0005  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000127143  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.839312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>