63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0017 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0045  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 75 bp  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0928705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna46  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0039  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0089  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0025  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000303691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14170  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.855611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  100 
 
 		 1485 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>