13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0012 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0045  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>