13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0013 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0004  tRNA-Arg  96 
 
 		 78 bp  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0025  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.876987  hitchhiker  0.00000168778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 690 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>