12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0034 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  95 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0004  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0032  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0383416  normal  0.814882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.220324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>