40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0034 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0045  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  0.246653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0503535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>