40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0001 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  95 
 
 		 67 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0018  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0002  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0037  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  93.94 
 
 		 108 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0199  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>