51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0051 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    95.83 
 
 		 203 bp  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0052  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.707391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  86.36 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0041  tRNA-Pro  90 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0049  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>