12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0027 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0003  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0015  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0022  tRNA-His  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0020  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>