16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0003 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0003  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0036  tRNA-Pro  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00366465  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0045  tRNA-Pro  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0562636  normal  0.0295646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 126 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 100 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>