21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0019 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0024  tRNA-Arg  89.06 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0048  tRNA-Arg  86.49 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0002  tRNA-Arg  87.69 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0039  tRNA-Arg  87.5 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173908  normal  0.0164425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04010  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000945479  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04380  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04300  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239342  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00420  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00120  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00563215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>