41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_tRNA-Pro-3 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0043  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.417054  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0011  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.908816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  92.11 
 
 		 1485 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0005  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0014  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0856304  normal  0.963089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0383416  normal  0.814882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>