10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0048 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0024  tRNA-Arg  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0039  tRNA-Arg  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173908  normal  0.0164425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0002  tRNA-Arg  95.31 
 
 
75 bp  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0035  tRNA-Arg  89.06 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0734164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  86.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  85.94 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>