14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0002 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0024  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0035  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0734164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0048  tRNA-Arg  95.31 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0039  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173908  normal  0.0164425 
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20650  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0010  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>