14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0039 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173908  normal  0.0164425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0024  tRNA-Arg  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0048  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0002  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0035  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0734164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0033  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0021  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1045  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1047  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>