22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0056 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0008  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0024  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0002  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0048  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1156  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.433457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0035  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0734164 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0001  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>