55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0016 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0030  tRNA-His  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24880  tRNA-His  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0039  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.639716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0040  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.646222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0021  tRNA-His  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0036  tRNA-His  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0002  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0005  tRNA-His  85.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  84.93 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0019  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0628666  normal  0.210857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0008  tRNA-His  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.400368  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R20  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180694  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0040  tRNA-His  82.43 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>